Astronomický ústav UK zajišťuje výuku pro studenty magisterského studia oboru astronomie a astrofyzika. Výuka začíná v letním semestru třetího ročníku úvodními přednáškami základů astronomie a astrofyziky. V průběhu dalšího studia absolvují studenti přednášky z hvězdné astrofyziky, nebeské mechaniky, sluneční fyziky, kosmologie, galaktické astronomie, atd.